Для Виндоуз
http://dokan-dev.net/en/download/ вместе с dokan sshfs
Для Мак
http://macovod.net/2009/08/rabotaem-s-udalennoj-fajlovoj-sistemoj-po-ssh/
для Убунту
http://alexmuz.ru/ubuntu-eclipse-pdt-sshfs/
Более подробно http://habrahabr.ru/post/52310/
Кстати, мне кажется, или действительно собрка одна и та же Эклипса - Аптана Студио, очень сильно различается на Винде, Маке и и Убунте?